Hola Randall, para configurar tus Nameservers por defecto por favor realiza los siguientes pasos:

1. WHMCS > Ajustes generales > Dominios
2. En el Apartado Nameservers modifica el valor por el de tus nuevos Nameservers.
3. Clic en guardar cambios.

Una vez guardado los cambios por favor realice estos pasos:

1. Ajustes> Servidores
2. Remplace los Nameservers por sus nuevos Nameservers personalizados.
3. Finalmente clic en guardar

Para su comodidad adjunto capturas de pantalla, por favor déjeme saber si logro realizarlo, quedo pendiente.