Hola David, tu pregunta es muy general y en general esto es algo que tu configuras de forma local con tu WHMCS, este sistema de hecho ya viene con multiples opciones de cobros con tarjeta pre instaladas que puedes configurar de acuerdo a las condiciones de tu pais.

Por ejemplo, algunas opciones excelentes son:

• http://www.2checkout.com
• El mismo modulo de PayPal de WHMCS te deja cobrar sin cuenta de PayPal, con tarjeta directo

Puedes revisar este articulo donde te brindamos orientación general sobre el tema: https://aprende.nodored.com/docs/pasarelas-de-pago-en-whmcs/

Coméntame si te sirve por favor